Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms