Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HJURPQ8NCD3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms