Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT2Q8N9I0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT2Q8N9I0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms