Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms