Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME8Q8N427 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms