Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00518Q8N0U6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00518Q8N0U6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms