Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APTXQ7Z2E3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms