Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)18.08■□□□□ 0.485e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-204ENST00000525039 1780 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.485e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-212ENST00000530407 1472 ntTSL 216.74■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.165e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 515.82■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 215.05■□□□□ -05e-7■■■□□ 17.8
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SND1Q7KZF4 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 514.11□□□□□ -0.155e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.275e-7■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 SLC37A4-203ENST00000524428 1526 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.475e-7■■■□□ 17.8
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SND1Q7KZF4 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-6■■■□□ 17.8
SND1Q7KZF4 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.155e-13■■■□□ 17.8
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SND1Q7KZF4 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 17.8
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SND1Q7KZF4 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.38e-7■■■□□ 17.8
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SND1Q7KZF4 BCAT1-208ENST00000544418 2320 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.256e-7■■■□□ 17.7
SND1Q7KZF4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-7■■■□□ 17.7
SND1Q7KZF4 OS9-215ENST00000550699 553 ntTSL 314.95□□□□□ -0.021e-16■■■□□ 17.7
SND1Q7KZF4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 17.7
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SND1Q7KZF4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-8■■■□□ 17.6
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SND1Q7KZF4 ASAH1-226ENST00000636435 4611 ntTSL 211.89□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 17.6
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SND1Q7KZF4 ASAH1-238ENST00000636828 3365 ntTSL 25.87□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 17.6
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SND1Q7KZF4 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 513.72□□□□□ -0.212e-10■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 VMP1-203ENST00000586245 544 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-9■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 VMP1-202ENST00000585847 545 ntTSL 213.12□□□□□ -0.313e-9■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 TMEM179B-202ENST00000526546 400 ntTSL 29.3□□□□□ -0.921e-7■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 SLC13A5-211ENST00000575230 547 ntTSL 515.64■□□□□ 0.092e-10■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 320.14■□□□□ 0.812e-15■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 220.05■□□□□ 0.82e-15■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-8■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-8■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-8■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.76e-8■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-7■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.34e-7■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-7■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.825e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 FKBP14-202ENST00000412494 703 ntTSL 28.13□□□□□ -1.115e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 FKBP14-203ENST00000419018 1085 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.35e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 ATF6-202ENST00000476437 778 ntTSL 55.53□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 17.6
SND1Q7KZF4 KRT8-211ENST00000549176 770 ntTSL 211.5□□□□□ -0.576e-7■■■□□ 17.5
SND1Q7KZF4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.5
SND1Q7KZF4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 17.5
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