Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM179Q6ZVK1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms