Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPGS1Q6ZTW0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms