Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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