Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms