Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00299Q6ZSB3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms