Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM136Q6ZRR5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms