Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms