Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM72Q6ZMU5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms