Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms