Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6Q795 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q6Q795 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q6Q795 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6Q795 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6Q795 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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