Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO38Q6PIJ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms