Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC4Q6P2E9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC4Q6P2E9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms