Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDC42EP5Q6NZY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms