Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF544Q6NX49 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms