Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms