Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms