Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms