Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRAGBQ5VZM2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms