Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENND4CQ5VZ89 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENND4CQ5VZ89 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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