Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD13Q5VXD3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms