Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD1Q5VV17 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD1Q5VV17 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms