Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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