Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms