Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC122Q5T0U0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms