Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP170Q5SW79 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms