Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC39AQ5SRH9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms