Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms