Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms