Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM41BQ5BJD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms