Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LACTB2Q53H82 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms