Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC184Q52MB2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC184Q52MB2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms