Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms