Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC153Q494R4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms