Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM12Q3MHD2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms