Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms