Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms