Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC57Q2TAC2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms