Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms