Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms