Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TXNRD1Q16881 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNRD1Q16881 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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