Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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