Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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NRF1Q16656 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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NRF1Q16656 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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NRF1Q16656 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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NRF1Q16656 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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NRF1Q16656 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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